istanbul il özel idaresi ağız ve diş hastalıkları hastanesi Şişli Etfal Hastanesi Diş Kliniği olarak çalışırken 27 Nisan 1999 tarihinde Sağlık Bakanlığının emri ile Şişli Ağız ve Diş Sağlığı Merkezi olarak ayrı bir kurum haline gelmiştir.

26 Haziran 2003 tarihinden itibaren İstanbul İl Özel İdaresinin yaptırmış olduğu Kâğıthane İlçesi sınırlarında bulunan şimdi kullanılan müstakil binasına taşınmış olup Şişli Ağız ve Diş Sağlığı Merkezi olan adı İSTANBUL İL ÖZEL İDARESİ AĞIZ VE DİŞ HASTALIKLARI HASTANESİ olarak değişmiştir.

5283 sayılı yasa gereği SSK’ya bağlı bulunan SSK Okmeydanı Eğitim ve Araştırma Hastanesi’ne bağlı Ağız ve Diş Sağlığı Polikliniği 22.02.2005 tarihinden itibaren çalışan personeli ve demirbaş eşyası ile birlikte Hastaneye nakledilmiştir.

Başlangıçta 21 ünit ile hizmete başlayan Hastane 1999 yılından bugüne kadar ünit sayısını 132’ye çıkarmıştır. Hastanede Entegre Kliniklerde toplam 110 ünit, Ağız Diş ve Çene Cerrahisinde 8 ünit, (5 Ameliyathane, 1 ünit Yataklı Servis, 2 ünit poliklinik), Pedodontide 10 ünit ile hizmet vermeye devam etmektedir. Ağız Diş ve Çene Cerrahisinde Yataklı servisinde 22 yatak bulunmakata olup 1 engelli odası, 1 izolasyon odası ve 2 yataklı post-op odası bulunmaktadır. Pedodonti (Çocuk Dişler) Kliniğinde 10 adet ünit bulunmaktadır, Radyoloji ve Görüntüleme Biriminde oral görüntüleme teknikleri için Periapikal, Dijital – Analog, Panaromik, Sefalometrik röntgen, RVG cihazları bulunmaktadır. Hastanede ayrıca hareketli (bölümlü ve tam) protezlerin yapıldığı Diş Protez Laboratuarı mevcuttur.